Search results for "diversité microbienne"
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Mapping and determinism of soil microbial community distribution across an agricultural landscape.
2015
Article en open access; International audience; Despite the relevance of landscape, regarding the spatial patterning of microbial communities and the relative influence of environmental parameters versus human activities, few investigations have been conducted at this scale. Here, we used a systematic grid to characterize the distribution of soil microbial communities at 278 sites across a monitored agricultural landscape of 13km(2). Molecular microbial biomass was estimated by soil DNA recovery and bacterial diversity by 16S rRNA gene pyrosequencing. Geostatistics provided the first maps of microbial community at this scale and revealed a heterogeneous but spatially structured distribution…
Ecomic - RMQs : Cartographie de la diversité microbienne des sols à l'échelle de la France
2009
aeres : C-AFF; National audience; no abstract
Optimisation de la procédure d'extraction d'ADN des sols pour caractériser la diversité microbienne tellurique par le pyroséquençage des gènes riboso…
2013
Depuis plusieurs années, les communautés microbiennes du sol (bactériennes et fongiques) sont étudiées au travers de leur ADN. Le mode d’extraction de l’ADN du sol revêt donc une importance capitale pour décrire la biodiversité microbienne. A ce jour, de nombreuses procédures d’extraction d’ADN (commerciales ou non) des sols sont disponibles et utilisées. Il est cependant difficile de comparer les résultats d’études ayant utilisés différents protocoles d’extraction. L’emploi d’une méthode d’extraction standardisée est donc devenu indispensable pour comparer les résultats de différents laboratoires, comme la norme “ISO-11063: Soil quality – Method to directly extract DNA from soil” développé…
Relation entre mode d’usage agronomique, diversité microbienne et turn-over des matières organiques dans le sol
2011
Affiche, résumé; International audience
Contribution à l'élaboration de biodescripteurs microbiens pour l'évaluation de l'état biologique et la compréhension du fonctionnement du sol
2013
Le séquençage massif pour caractériser la diversité microbienne des sols, standardisation et applications au sein de la plateforme GenoSol
2014
EA SPE GenoSol EcolDur; National audience; Les microorganismes (bactéries, archées et champignons) sont les organismes les plus abondants et les plus diversifiés de la matrice sol. Ils représentent un réservoir encore largement méconnu et presque infini de ressources génétiques, fortement impliqué dans le fonctionnement biologique du sol et plus largement dans la plupart des services écosystémiques fournis par ce sol. Malgré ce rôle central dans le fonctionnement des écosystèmes, nos connaissances sur la diversité génétique, taxonomique et fonctionnelle de ces microorganismes restent limitées à ce jour. Ceci s’explique essentiellement par des difficultés techniques pour accéder à ces organi…
Lionel Ranjard : La passion des sols et de leur diversité microbienne
2012
EA GenoSol EcolDur Magazine article Portrait
La perte de diversité affecte la stabilité structurelle et fonctionnelle des communautés microbiennes du sol
2013
Les activités anthropiques impactent fortement la diversité des communautés microbiennes du sol. La question se pose de savoir dans quelle mesure ces modifications de diversité peuvent remettre en cause la capacité des sols à assurer les services dont dépendent les sociétés humaines. Pour répondre à cette question, une meilleure compréhension de la relation diversité-stabilité-fonction est indispensable. En 1999, Yachi et Loreau développent le concept d'assurance écologique selon laquelle une forte diversité d'espèces dans un écosystème permet une meilleure stabilité de son fonctionnement. Cette relation a largement été étudié chez les végétaux mais reste encore inconnue chez les microorgan…
Modèles prédictifs de l'abondance et de la diversité microbienne tellurique
2013
Le sol représente avant tout pour l’homme un support de construction et de production agricole. Sa surexploitation depuis le développement de l’agriculture intensive et de l’industrialisation a menée à une érosion significative de sa biodiversité microbienne et par la même des fonctions et services remplis par cette biodiversité. Dans ce contexte, il devient donc urgent de fournir aux utilisateurs des sols les moyens d’évaluer l’état microbiologique de leur support de production et l’impact des pratiques associées (agricoles, industriels). Toutefois, face à la demande croissante des utilisateurs des sols pour caractériser l’état biologique de leur milieu de production il devient urgent d’am…